Kauno sakralinės muzikos mokykloje mokoma groti vargonais. Vargonai – instrumentų karalius. Kaip ir kiekvienas karalius, turi panašumų į daugelį, bet, iš tiesų nei į vieną nepanašus. Klaviatūromis (manualais) vargonai panašūs į klavišinį instrumentą, savo sandara – į pučiamuosius, o grojimas vargonais panašus į dirigavimą dideliam orkestrui. Pamokų metu mokiniai supažindami su instrumentu, grojimo specifika, registrais, mokosi groti rankomis ir kojomis vienu metu, skaityti natas iš nedidelės (3 eilučių) partitūros. Net jei ir sunkiau sekasi, jau po pusmečio mokiniai geba pagroti lengvesnį kūrinėlį, giesmę, o įgyti įgūdžiai praverčia tolimesnėje muzikinėje ir nemuzikinėje veikloje.